Hernanes se transformou em um dos principais jogadores do Tricolor Paulista e do futebol brasileiro nos últimos anos. Ele chegou ao clube com 15 anos, em 2001. Subiu aos profissionais em 2005. Depois de ser emprestado ao Santo André, em 2006, ele retornou e começou a escrever sua vitoriosa carreira no São Paulo.
No ano seguinte, ele esteve na campanha do pentacampeonato. Hernanes foi eleito pela CBF o melhor volante do Campeonato Brasileiro em 2007. Naquela temporada, o são-paulino disputou 45 jogos e marcou 5 gols. Boa fase que se estendeu nos próximo anos.
Em 2008, além de mais um título nacional, Hernanes foi eleito o melhor volante e o craque da competição. No ano, ele fez 53 partidas e marcou sete vezes. Já nos dois últimos anos, Hernanes mostrou seu lado artilheiro, marcando 10 gols por ano. Com a camisa do São Paulo, são 216 jogos no total e 35 gols marcados.
