Em 2012, Édson Silva é contratado pelo São Paulo e estreia marcando gol contra o Botafogo-SP, no Morumbi.
Em 2013, após passar o ano anterior a maioria das vezes no banco, conseguiu desbancar o ex-capitão da Seleção Brasileira Lúcio e teve uma sequencia no time titular do tricolor.
Édson Silva começou 2014 ameaçado de ser dispensado pelo clube do Morumbi, por conta da reformulação para a nova temporada. Porém, acabou permanecendo, e com a lesão do titular da posição (Antonio Carlos) e a carência de zagueiros no elenco acabou sendo titular em uma sequência de jogos do Tricolor na temporada. Ao lado de Rafael Tolói, o antes questionado zagueiro vem sendo muito elogiado pela imprensa e pela torcida pela dedicação e raça em campo. Justamente nesse período, o São Paulo deu uma espetacular arrancada no Brasileirão, diminuindo a diferença de pontos para o líder Cruzeiro, inclusive vencendo o mesmo em uma partida, onde o time foi muito superior e o zagueiro foi eleito o melhor em campo pelo técnico Muricy Ramalho. No Dia 27 de Outubro Édson Silva marcou seu 5 Gol com a Camisa Tricolor onde fez o seu Gol de Cabeça contra o Goias. No dia 30 de novembro de 2014, Edson Silva marcou mais um gol, desta vez contra o Figueirense, abrindo o placar no Morumbi, porém, o Figueirense chegou ao empate com Mazola e o jogo terminou em 1 a 1. Edson Silva diz estar vivendo o melhor momento da carreira no Tricolor.
Em dezembro de 2015, após o término de seu contrato, Edson Silva deixa o tricolor, onde conquistou a Copa Sul-Americana de 2012.
MANO O EDSON SILVA https://t.co/FFmvwpHdhn
— ?? Luiz Gustavo Queiroga (@lgqueiroga) February 3, 2020
São Paulo, Edson Silva, Zona mista, Campeonato Paulista, São Paulo x Novorizontino
Esse Rodrigues santos so pode ser galinha preta vai se *****
Joga menos do que o Bordon, já velho do Legends.
Teve um momento que ele era o melhor zagueiro atuando no São Paulo k
Que eu me lembre a maior felicidade que ele me deu foi ter saido do SP. Típico jogador moderno, ruim que tem empresário forte.
Bon jogador nas hoje ele não joga seria o quinto reserva
Torcida Tricolor especialista em queimar jogadores...eis um de dezenas que foram queimado pela torcida em principal a organizada!Lento mas tinha tempo de bola e era bom em bolas aéreas
Tão veloz que uma lesma na lua ganhava dele na Terra! Lento de mais!
Fale mal dele quem, mas nunca lhe faltou raça e dedicação. Bom zagueiro.
Feliz pra ele, *** ra torcida era um sufoco ver Edson Silva, Paulo Miranda e Lucão juntos
Valeu Edson silva, jogava simples mas jogava sério, boa sorte em sua carreira!!!!!