O São Paulo ainda alega que a sua primeira fase - coroada com o título do Campeonato Paulista de 1931 - foi encerrada por desentendimentos políticos e federativos. De qualquer forma, a instituição conseguiu se reerguer e teve a 'segunda' fundação nos fundos de um pequeno porão alugado na Praça Carlos Gomes, número 38.

São Paulo festeja sua segunda fundação sem esquecer o título que ganhou antes dela, o Paulistão de 1931
A assembleia do dia 16 de dezembro de 1935 do São Paulo Futebol Clube foi iniciada às 20 horas, no escritório de Silva Freire, localizado na Rua Onze de Agosto. A discussão da aprovação das regras da nova instituição durou cerca de duas horas.
Entre os que participaram da realização do estatuto, destaque para Sebastião Portugal Gouvêa, tio de Marcelo Portugal Gouvêa, presidente do São Paulo durante a conquista da Libertadores e do Mundial de Clubes de 2005, que faleceu em novembro de 2008.
Após a definição das primeiras questões burocráticas, o São Paulo teve a sua eleição. O primeiro presidente foi Manoel do Carmo Meca, que trabalhou com dois vices: Alcides Borges e Francisco Pereira Carneiro.
O "novo" São Paulo, que surgia sem nenhum patrimônio, hoje se orgulhar por ter o estádio do Morumbi e o Centro de Formação de Atletas Laudo Natel, em Cotia. Além disso, os tricolores ainda se gabam pelos três títulos mundiais, as três Libertadores, as seis conquistas nacionais e outros 22 troféus do Campeonato Paulista (incluindo o do São Paulo da Floresta).
