Após encerrar sua terceira temporada como goleiro titular do São Paulo, Rafael se destacou em um ano difícil para o clube. O time enfrentou uma série de desafios, incluindo uma performance irregular, eliminações, lesões constantes e dificuldades financeiras. Ainda assim, Rafael se destacou como um dos jogadores mais consistentes do elenco tricolor, obtendo 45,9% de aprovação de sua temporada em uma enquete realizada pela Gazeta Esportiva.
Em um total de 66 jogos disputados pelo São Paulo em 2025, Rafael participou de 59, acumulando impressionantes 5.224 minutos em campo, o que o tornou o atleta com mais partidas no time. Luciano, seu companheiro, se aproximou ao totalizar 56 jogos. Apesar de um sistema defensivo vulnerável, que permitiu 57 gols ao longo do ano, Rafael conseguiu minimizar os danos, desempenhando um papel fundamental nas atuações da equipe.
Um dos pontos altos da temporada de Rafael foi sua performance memorável na Libertadores, em um jogo decisivo contra o Atlético Nacional. Em um momento crítico da partida, ele fez uma defesa espetacular que salvou o São Paulo de sofrer um gol de empate. Embora o jogo tenha avançado para os pênaltis, Rafael ainda brilhou ao defender a primeira cobrança, ajudando o time a avançar na competição com uma vitória por 4 a 3 e sendo aplaudido no Morumbi como um dos heróis da classificação.
No entanto, nem tudo foram flores para o goleiro. Um episódio polêmico ocorreu durante as oitavas de final da Copa do Brasil, quando Rafael foi expulso logo nos primeiros minutos do confronto contra o Athletico-PR. A equipe, que havia vencido o primeiro jogo por 1 a 0, teve que se readequar defensivamente e, após empatar, acabou sendo eliminada ao perder as cobranças de pênalti, deixando a situação ainda mais complicada para o clube.
Apesar das adversidades do ano, é indiscutível que Rafael se provou uma peça valiosa para o São Paulo. Ele é, sem dúvida, o goleiro mais bem-sucedido do clube desde a aposentadoria de Rogério Ceni, e suas atuações na temporada reafirmaram sua importância para a equipe.
