A passagem de Nenê pelo Vasco também é bastante semelhante ao roteiro apresentado até agora no Tricolor paulista. Contratado em agosto de 2015 para tentar afasta o time carioca do rebaixamento para a Série B, ele assumiu o papel dde líder. Em 2016, participou ativamente da campanha do título estadual, que veio com invencibilidade, com o time treinado por Jorginho.
Porém, com o tempo, a relação se desgastou. A chegada de Milton Mendes, em março de 2017, marcou o início do processo que resultou na saída do meia de São Januário. Figura frequente no banco de reservas, ele passou a expor a sua insatisfação. Na época, até mesmo se cogitou a sua transferência, mas nenhuma proposta oficial apareceu.
Como tinha contrato com o clube, permaneceu por lá. Com a mudança no comando e o início do trabalho de Zé Ricardo, ele voltou a ser visto como um jogador importante. Por todo esse histórico, muita gente no Vasco da Gama ainda o com jogador mimado. Ainda assim, já uma movimentação de torcedores do time carioca que sonham com o retorno de Nenê.
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