Enquanto tenta concretizar a contratação de Washington, o São Paulo também faz uma reformulação no elenco para 2009. Dos jogadores que terão o contrato encerrado no fim deste ano, Júnior e Jancarlos não estão nos planos do clube paulista para a próxima temporada. Além da dupla, Éder Luis teve o contrato de empréstimo encerrado e volta para o Atlético-MG .
Depois de uma análise da diretoria, feita na última semana, foi decidido que Júnior e Jancarlos não seguirão no Tricolor. O primeiro está no clube desde 2004 e foi aproveitado em poucas partidas no ano. Durante a temporada, chegou a dar entrevistas mostrando insatisfação com a situação no clube.
Jancarlos chegou cercado de expectativas, principalmente para a Libertadores, mas não rendeu o que o técnico Muricy Ramalho esperava. Com os bons desempenhos de Jean no meio e de Zé Luis improvisado na lateral, Jancarlos acabou tendo poucas chances. O Internacional teve interesse em seu futebol, mas já descartou.