Júnior foi emprestado pelo Tricolor gaúcho em julho deste ano, após ter retornado do Joinville, em que disputou apenas oito partidas pela Série B deste ano. A ideia inicial dos dirigentes era dar rodagem ao jogador, que teve poucas chances com Roger Machado. Internamente, falava-ser até que o jovem foi atrapalhado por problemas extracampo em Porto Alegre.
O que não ocorreu em São Paulo. O lateral foi titular durante toda a temporada na equipe de André Jardine. Participou, assim, das conquistas da Libertadores, da Copa Ouro, da Copa do Brasil, do Paulistão e da Copa RS. A geração é considerada a mais promissora da base do São Paulo. Já com 20 anos, Júnior deve ser integrado ao elenco de Rogério Ceni em 2017.
O jogador nutria uma relação antiga com o Grêmio. Estava na base do clube desde os 13 anos de idade. Junior despertou a atenção de Felipão após se destacar na Copa São Paulo de 2015. Foi integrado ao elenco e chegou a atuar em 11 partidas pelo profissional naquele ano. Perdeu espaço com Roger Machado e acabou emprestado ao Joinville no início deste ano, antes de retornar ao elenco gremista e ser repassado ao Tricolor paulista.