Poucas horas após ser anunciado pelo São Paulo, Neilton publicou em seu perfil no Instagram uma foto em que, ainda garoto, está com a camisa do clube ao lado do pai. A publicação foi uma forma de se desculpar por um tuíte antigo em que chamava o clube de "lixo".
A polêmica mensagem no Twitter foi descoberta por alguns torcedores do São Paulo, que passaram a retweetar. A mensagem era: "To assistindo o jogo do lixo são paulo com a minha #mãe", escrita em 16 de fevereiro de 2011, quando defendia o Santos.
Alguns torcedores tricolores chegaram a esbravejar contra o post, inclusive criticando a nova contratação do São Paulo - em troca o volante Hudson foi para o Cruzeiro.
Para amenizar o caso, Neilton publicou a foto citada acima e o seguinte texto no Instagram:
"Estou muito feliz por chegar ao São Paulo. Vestir essa camisa me dá muito orgulho e também à minha família, que é toda são-paulina. Nessa foto, com sete anos, estou com meu pai com o uniforme do Tricolor. Aproveito para pedir desculpas pelo tweet que publiquei quando era ainda mais jovem. Na época eu era apenas um garoto que sonhava jogar futebol profissionalmente e defendia um clube rival. Foi um erro, que não representa o que pensava e muito menos o que penso hoje. Estou realizando um sonho pessoal e vou me dedicar sempre para honrar essa camisa e dar muitas alegrias aos torcedores", escreveu Neilton.