Depois de uma longa novela com joia da base, enfim o novo acordo foi assinado. Seu vínculo anterior havia vencido no dia 15 de fevereiro e desde então Joanderson estava sem clube, em negociação que se arrastava com o Tricolor desde o fim da última temporada.
O São Paulo firmou um padrão financeiro para os garotos das categorias de base no fim do ano passado, e a renovação de Joanderson esbarrou justamente nisso, já que o estafe do jogador não aceitou a proposta.
Porém, no dia 22 abril, o nome do jogador já aparecia no BID (Boletim Informativo Diário) da CBF, com contrato valido até fevereiro de 2018. O São Paulo exerceu o seu direito de preferência de renovação, previsto pela Lei Pelé, e protocolou a proposta na Federação Paulista de Futebol.
As negociações recomeçaram entre o São Paulo e o empresário do jogador, que estudavam uma extensão do contrato até 2020, no entanto o novo contrato foi firmado até 2018.