Em 2024, o São Paulo apresentou uma redução significativa no número de lesões em seu departamento médico, diminuindo o total de casos de 55 para 47, o que equivale a uma queda de 15%. Apesar dessa melhora, o número de lesões ainda se destaca de forma negativa quando comparado a outros clubes da Série A, pois apenas o Fluminense teve um número maior de atletas em tratamento médico. Desde que as estatísticas começaram a ser acompanhadas em 2016, o São Paulo tem enfrentado um índice elevado de lesões, com a melhor marca registrada em 2020, com 33 casos. A média anual de lesões é de 48, e o recorde absoluto foi em 2016, com um total de 58 lesões.

O departamento médico do clube realiza uma avaliação abrangente, não se limitando apenas ao número total de lesões, mas também considerando a incidência de problemas por tempo de exposição em treinos e partidas, assim como o tempo médio de recuperação. Os dados revelam que a incidência de lesões no São Paulo ficou 58% abaixo da média de 8,1 lesões a cada 1000 horas de exposição, conforme a literatura científica. Além disso, o clube destacou que seus jogadores se recuperam em média mais rapidamente do que os padrões internacionais sugerem.

Embora o Tricolor Paulista comemore a evolução nas recuperações, algumas lesões seguiram exigindo períodos longos de ausência. Apenas dez lesões exigiram um período de recuperação superior a 28 dias, o que representa uma redução significativa em relação ao ano anterior, quando houve oito casos a mais. Um exemplo positivo foi a recuperação do volante Alisson, que, após uma fratura no tornozelo direito, retornou aos treinos em apenas três meses, superando as expectativas iniciais, que apontavam um retorno apenas em 2025.

Entretanto, nem todos os jogadores tiveram uma recuperação rápida. Pablo Maia, um dos volantes titulares até abril, sofreu uma lesão significativa na coxa que resultou em cirurgia e o afastou de toda a temporada, com 48 partidas fora. Outros jogadores, como João Moreira e Wellington Rato, também enfrentaram dificuldades, com ambos passando pelo departamento médico quatro vezes no ano. As lesões musculares, principalmente na coxa, foram as mais recorrentes, totalizando 21 problemas registrados neste local do corpo. Tornozelos e joelhos aparecem a seguir na lista de lesões no elenco em 2024.