Jogador destro , ''Martín Ligüera é o típico camisa 10 e se destacou no Olímpia (PAR) e no Nacional (URU), onde começou a jogar em 1996. Especialista em bolas paradas, o uruguaio jogou também pelo Cerro (URU), Defensor Sporting (URU), Fénix (URU), Real Mallorca (ESP), Grasshopper (SUI), San Luis (MEX) e Alianza Lima (PER). Seu último clube foi o Unión Española (CHI), onde atuou na temporada 2010/2011.
Em 2002 foi eleito o melhor jogador do futebol uruguaio, onde se destacou também em 2005, quando foi o artilheiro do campeonato regional com o Nacional (URU). Em sua passagem pelo Paraguai, em 2009, foi eleito o melhor jogador estrangeiro.
Ligüera integrou a Seleção Uruguaia entre 2002 e 2005. Na função de meia de criação, destacando-se pela visão de jogo, velocidade e alta média de gols
